财经研究院的前身是财经研究所，成立于1978年11月，2005年更名为财经研究院。1978-2006年间，研究院的主要任务是科学研究，从2007年开始招收硕士研究生，逐渐转变为以科研、教学为主的机构。

2007年，我院建立了教育经济与管理硕士学位点，这是自建院以来的首个学位点，研究方向为教育财政和教育金融。根据学校学科发展整合的需要，2010年，该学位点归至政府管理学院。2011年，我院获得区域经济学硕士学位点和世界经济博士学位点，研究院学科建设进入了一个崭新的阶段。